Stargate Universe, la bande dessinée commence dès la fin de la saison deux de la célèbre série télévisée de science-fiction, avec l'équipage et les passagers réticents de Destiny afin de traverser une vaste étendue d'espace sans marge d'erreur. Avec presque tout l'équipage de l'ancien vaisseau spatial Destiny dans une animation suspendue, seul Eli Wallace est laissé éveillé pour réparer sa propre gousse de stase avant que le temps ne s'écoule. Alors qu'il court contre le temps, un danger nouveau et inattendu menace le plan fragile conçu pour garder tout le monde en vie et loin des étrangers qui les poursuivaient. Quelle étrange nouvelle menace affronte Eli, le colonel Young, le docteur Rush et les autres?
