1800 : alors qu'il traverse les Alpes enneigées avec son armée, Napoléon Bonaparte découvre un trésor fabuleux. Ne pouvant le transporter, et afin de le léguer à ses héritiers, il invente avec l'aide de son plus fidèle officier une énigme qui, une fois résolue, mènera jusqu'à lui. Mais à la mort de l'empereur, les indices soigneusement disséminés disparaissent. De nos jours : explorant les marais du Maryland, Remi et Sam Fargo découvrent, échoué dans un bras mort de la rivière, un sous-marin allemand datant de la Seconde Guerre mondiale.
À l'intérieur, une bouteille de vin de la cave perdue de Napoléon. Intrigués par les symboles qui ornent l'étiquette, ils se lancent à la recherche des bouteilles manquantes. De son côté, Hadeon Bondarouk, un millionnaire russe d'origine perse, est lui aussi prêt à tout pour retrouver ce mystérieux trésor, qui pourrait bien en cacher un autre.