En 1981, le pape Jean paul 1er s'éteint mystérieusement, un mois après son élection. Vingt quatre ans plus tard, l'état de santé de son successeur inquiète la communauté internationale mais réjouit le secrétaire d'état du Vatican, le peu scrupuleux Lorenzo Petroni, qui espère bien se voir confier, cette fois, les clés de Saint Pierre. Seulement pour garder la main, il lui faut écarter ceux qui menacent son autorité: le cardinal Giovanni Donelli qui mène l'enquête au sein de la banque du Vatican et surtout la fougueuse Allegra Bassetti, une archéologue spécialisée dans les analyses ADN qui s'est mise en tête de rassembler les fragments d'un certains rouleau Oméga dans une Jérusalem en guerre. Tous deux vont vite découvrir que cette relique attire toutes les convoitises.