Après la disparition mystérieuse de Moïra, son assistante, l'archéologue Paul de Brissac engage Sabrina Langer, jeune journaliste au chômage, pour l'aider à monter à New York une exposition de pièces exceptionnelles, dont le sceptre de l'empereur Titus. A la demande de Brissac, Boris Steinberg, agent du Mossad, enquête sur la disparition de Moïra, elle aussi au service du Mossad, qui savait tout des dernières découvertes de Paul sur l'Arche d'Alliance. Ramené par Titus à Rome en 70, retrouvé par les Wisigoths puis les Templiers, le trésor de l'Arche se trouverait aujourd'hui sous l'esplanade des Mosquées à Jérusalem. Si tous les ingrédients de L'Arche d'Alliance l'apparentent au thriller historique, c'est aussi un roman sur l'identité juive, son histoire, ses drames et ses légendes, à travers deux générations.