En 2029, l'Incident des Augs, orchestré par une coalition de forces anonymes, déclenche des crises de folie meurtrière chez des millions de personnes cybernétisées. Adam Jensen, ex-policier aug, s'éveille dans un monde nouveau où la suspicion règne et où les augmentés sont en proie à la haine, la peur et la discrimination.
Pour démasquer les responsables de l'Incident qui s'apprêtent à frapper de nouveau, Jensen devra faire face à son passé, renouer de vieilles alliances et risquer tout ce qu'il lui reste. Mais dans un monde dévasté par les secrets et le doute, la vérité peut-elle encore triompher ?