Après la guerre de Sécession, Scébanja revient sur les terres où il est né esclave afin d'acheter une ferme et de se comporter en homme libre qu'il pense être enfin devenu. Mais c'est compter sans la haine des Blancs. Appauvris par la guerre qui les a dépossédés d'une main-d'œuvre gratuite, ils voient d'un mauvais œil leurs esclaves d'antan s'émanciper. Le Ku Klux Klan entre en action.
À travers un événement historique précis, la naissance du Ku Klux Klan aux États-Unis, Les Croix en feu pointe du doigt une réalité toujours criante, le racisme. Pierre Pelot signe là un texte réaliste, sans complaisance ni misérabilisme, mais aussi lucide, puisque les deux personnages, sachant bien que leur victoire n'est que temporaire, préfèrent fuir vers le Nord, là où les croix ne brûlent plus dans la nuit.