Jonathan Kellerman est né le 9 août 1949 à New York. Très tôt, à l'âge de neuf ans lui vient l'envie d'écrire. Il accomplit des études de psychologie à l'université de Californie et se spécialise en psychologie clinique pédiatrique. En 1980 il publie Psychological Aspects of Childhood Cancer. Deux ans après la publication de son premier roman Le Rameau brisé, couronné du prestigieux prix Edgar-Allan-Poe en 1986, il se consacre entièrement à l'écriture. Ses études et son activité professionnelle lui servent de cadre pour l'écriture de ses romans. Son héros Alex Delaware, un psychologue pour enfants, semble être son double littéraire.

Il est marié à Faye Kellerman également écrivain. Ils vivent avec leurs quatre enfants à Los Angeles. L'un de leurs enfants, Jesse Kellerman, est aussi devenu auteur de littérature policière.