Montcoutant, France, 1684. Mérance Duvernay, 16 ans, possède un talent de guérison par les plantes. Promise à un jeune médecin prétentieux, elle décide de fuir ce mariage imposé par son père, un pasteur protestant. Recueillie par un maître apothicaire, Gustave Barbé, Mérance deviendra apprentie au sein de sa boutique. Mais, à la mort de son mentor, elle est accusée de l'avoir empoisonné pour hériter de son entreprise. La jeune femme devra s'enfuir à nouveau pour sauver sa peau. Elle se réfugie d'abord chez deux amies puis, à la suite de la révocation de l'Édit de Nantes mettant fin aux guerres de religion, elle part à la recherche des membres de sa famille, qui ont dû s'expatrier pour survivre. Accompagnée de Justin, dont elle est secrètement amoureuse, Mérance se dirige vers Genève avant d'atteindre Strasbourg, où elle rencontre enfin son destin. Se déroulant à l'époque précédant les Lumières, cette intrigue entremêle avec soin les thèmes des corporations et de la sorcellerie.
La Protégée de l'apothicaire se révèle un excellent premier roman de Stéphanie Tétreault, avec ses personnages attachants, ses scènes remplies d'émotion, ainsi que ses notions historiques bien intégrées au récit.