TOME 1 - Un jour, dans la ville de San Francisco, un libraire nommé Nick Fleming et son employé Josh Newman se font attaquer par deux golems et leur créateur, le diabolique Dr John Dee. Alertées, Perry Fleming (la femme de Nick Fleming) et Sophie Newman, la sœur jumelle de Josh, se précipitent dans la librairie. Dee vole un livre : "le Codex", le livre d'Abraham le juif, permettant la domination des Ténébreux, restés cachés des années. Il enlève aussi Perry. Par chance, Josh réussit à reprendre les deux dernières pages du Codex. Nick Fleming, qui n'est autre que le célèbre Nicolas Flamel, et les jumeaux s'enfuient, cherchés par Dee et les Ténébreux qu'il sert. Josh et Sophie, bien malgré eux, se retrouvent au centre d'une prophétie écrite il y a des siècles. Ils rencontreront Scathach, la déesse guerrière, Hécate, la déesse aux trois visages et son royaume des Ombres, Morrigan, la maléfique déesse des corbeaux, Bastet et d'autre personnages légendaires... Mais Josh et Sophie sont-ils les deux qui ne font qu'un ?